El modelo de asignación incluye, además del sistema de gestión (mercado, servicios públicos, concesiones, etc) el de transporte o conducciones en alta, desde las zonas productoras a las consumidoras. Entre ambas zonas, productoras y consumidoras, se definen ejes de trasvase; y dentro de cada uno de estos ejes las conducciones se agrupan en función de su uso (general, para abastecimiento de poblaciones y para aguas depuradas).

Del total de conducciones que intervienen en el sistema de transporte, se han seleccionado sesenta que integran la red básica general, y que constituyen el esqueleto del sistema.

Razones de naturaleza jurídica, económico-financieras y de eficacia determinan que la actual configuración del sistema de transporte se mantendrá a medio plazo.